全国首个RNA二代测序流程团体标准正式发布
导言:日前,由承启生物、暨南大学、华南理工大学、赛哲生物等单位联合编制的《RNA定量测序技术规程》团体标准(T/CI 121-2023),经中国国际科技促进会标准化工作委员会审批通过,正式发布。
日前,由承启生物、暨南大学、华南理工大学、赛哲生物等单位联合编制的《RNA定量测序技术规程》团体标准(T/CI 121-2023),经中国国际科技促进会标准化工作委员会审批通过,正式发布。这是全国首个RNA二代定量测序流程标准,其特点是可以几乎无视通常的RNA降解而得到高度一致的测序定量结果;样品的保存和运输也无需干冰,近程运输甚至室温即可。此标准大大降低了样本保存运输的成本,保证了各种样品的定量测序一致性和稳健性,对规范整个测序和精准医学行业有着至关重要的作用。
二代测序(或称新一代测序)是精准医学的基石,其将核酸打断成无数小片段,同时对数亿条小片段进行大规模平行测序以获得样品内的核酸信息。在医学检验中,DNA测序应用范围很小,因为基因组通常一辈子保持不变,只有少数癌症由DNA突变引起。而RNA由DNA转录而来,各基因的RNA表达量在各种生理和病理条件下都不同,因而用二代测序一次性测定多种RNA的量,就可以对几乎所有的疾病做到极为精确的诊断,甚至对一些重大疾病在症状出现之前很久就做到近乎100%的极早期预警。但如此有潜力的诊断方法,却迟迟未能在医学临床实践上落地实施,其主要原因是RNA非常脆弱,尽管人们通常采用干冰等昂贵的方式保存运输,但依然很容易降解;而以往的测序方法对降解样品轻则出现定量失准,重则完全测不出数据。并且,各测序单位使用的仪器不同、流程不同,数据也无法互通。这些因素使RNA二代测序难以作为诊断标准来推广应用。
由承启生物牵头研发编制的《RNA定量测序技术规程》团体标准,制定了一种RNA定量测序的标准流程,利用承启生物自主研发的FANSe算法的超强准确性和稳健性,使该流程可以无视通常的RNA降解:自然降解的RNA样品和未降解的样品,经过完全相同的流程,可以达到R2>0.98的定量相关性,误差与同一管样品测序两次相当,证明了这一流程的惊人稳健性。同时,该流程对目前市售的所有主流二代测序仪型号均可得到高度一致的定量结果。该流程对样品的保存运输也做了创新,并通过大量的商业化实践,可稳健地实现RNA样品国内常温运输或者普通冰袋运输,在7-10天的国际运输中也无需使用干冰。这大幅优化了目前的RNA样品冷链物流体系,大大降低了物流成本,并使得以往很难空运的样品可以在三天内空运到世界上任何一个主要城市。经过多个商业实验室的实践测试,该流程只需要对实验员进行简单培训,第一次实操即能达到满意的效果。可以说,该流程是首个高稳健性、全平台通用的RNA定量测序流程,对规范整个测序和精准医学行业、推动RNA测序的临床应用,有着至关重要的意义,解决“精准医学不精准”的世界性难题。
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