德国人工智能拓展冷冻电子断层扫描应用潜力
导言:德国科研团队开发了基于人工智能的软件TomoTwin,实现在低温电子断层扫描中精确识别、选择蛋白质,取代繁琐的手工选择,拓展了冷冻电子断层扫描(Kryo-ET)的应用潜力——有可能破译生物分子在细胞中的作用方式,从而揭示生命基础和疾病起源。
德国科研团队开发了基于人工智能的软件TomoTwin,实现在低温电子断层扫描中精确识别、选择蛋白质,取代繁琐的手工选择,拓展了冷冻电子断层扫描(Kryo-ET)的应用潜力——有可能破译生物分子在细胞中的作用方式,从而揭示生命基础和疾病起源。
新开发的TomoTwin通过学习能够将断层图中相似的分子进行筛分归类。软件的一个优势是提供了预先训练的“拣选模式”,通过取消训练步骤,软件可以在本地计算机运行,过去每张断层图像的处理时间在60-90分钟,现在马普超级计算机Raven上的处理时间减少到15分钟。目前,该软件只能检测细胞内大于150千道尔顿的球状蛋白或蛋白聚合物,科研团队希望未来可以扩展到膜蛋白、丝状蛋白和更小尺寸的蛋白。
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